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UMI-UDI接头试剂

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UMI-UDI接头试剂
产品描述
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IGT™ UMI Adapter & UDI Primer系列产品,包含双端UMI接头mix和UDI引物的接头试剂盒。两端各包含64种6 bp的UMI接头,可产生4096种组合UMI,其多样性足以区分原始DNA分子;UMI序列之间编辑距离≥3,可以更准确地矫正DNA分子在文库构建、靶向区域捕获和测序过程中产生的错误。同时,该系列产品可提供Illumina平台和MGI平台384种UDI序列供客户选择,能够满足高通量测序平台单条lane超高数据产量的混样需求。

艾吉泰康另提供AnchorSeq™ UMI Adapter & UDI Primer接头试剂盒,满足不同建库需求。

产品特点


接头连接效率高

● 优化接头设计和合成,保证高文库转化效率,高灵敏度检出低频变异。

辅助实现低频变异的准确检测

● 稳定检出丰度低至0.02%的ctDNA。通过双端UMI矫正可过滤掉99.9%的背景噪音。

独特的UMI序列设计方式

● 采用不完全随机的UMI序列设计(编辑距离≥3),避免因UMI序列错误引入的假阳性变异。

包含UDI扩增引物

● 包含双端唯一分样序列(Unique Dual lndex, UDI),极大程度避免交叉污染。 

数据表现


低频变异检测准确性高

投入25 ng的0.1% Horizon cfDNA参考标准品(Horizon HD780)进行建库,使用52 kb大小的panel进行探针杂交捕获,构建的文库使用NovaSeq 6000进行测序。去冗余前目标区域平均测序深度20000×条件下,已知8个突变位点均能检测到,灵敏度为100%。

表. Horizon 0.1% cfDNA参考样品的测序数据表现

显著降低假阳性位点识别数量

经过标准去冗余之后,可检测到Horizon标准品中有526个VAF低于3%的突变;结合使用UMI和比对到基因组上的坐标位置对数据进行单链一致序列合并(SSCS去重矫正)后,检测到163个VAF<3%的突变;相比之下,使用UMI进行cfDNA分子正负链错误矫正(DCS去重矫正)合并后,仅检测到15个VAF<3%的低频突变,其中包括8个已知突变位点。使用双端UM技术,低频等位基因的识别率与标准去重方法相比降低了97%。IGT™ UMI Adapter & UDI Primer可显著降低背景噪音。

图. Horizon标准品低频等位基因的识别率数据

Illumina UMI-UDI接头试剂盒


MGI UMI-UDI接头试剂盒


AnchorSeq 接头试剂盒


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