IGT™ ssDNA Library Prep Kit是一款通用型单链DNA建库试剂盒，可用于1 ng~50 ng DNA起始的甲基化文库和基因组文库构建，所构建的文库可进一步用于目标区域杂交捕获测序，或直接测序。在甲基化文库构建过程中，重亚硫酸盐处理会导致严重的DNA损伤、片段化、解链，另外，低质量或严重降解的DNA中也含有大量的DNA单链。IGT™ ssDNA Library Prep Kit可以对单链DNA进行接头连接，大幅提高DNA原始分子的利用率，提高文库的复杂性，在低起始量样本的甲基化文库和基因组文库构建中具有显著的优势。
产品特点
● 适合于cfDNA、FFPE DNA等低起始量样本，建库起始量可低至1 ng。
● 甲基化文库构建流程中，采用Post-BS建库策略，大幅提高DNA模板的利用率。
● 可有效提高文库复杂度，增加测序有效数据。
● 兼容全基因组甲基化测序、目标区域甲基化测序、全基因组测序和目标区域杂交捕获测序。
数据表现
适用于不同起始量样本，测序结果稳定
分别投入1 ng、5 ng、20 ng cfDNA（样本为NA12878细胞系gDNA，超声打断模拟cfDNA）进行单链建库，文库构建采用IGT™ ssDNA Library Prep Kit和IGT™ ssDNA Adapter & UDI Primer (for Illumina)，使用123 kb的Panel进行捕获，NovaSeq 6000平台PE150测序，测序数据量平均为1.8 Gb。
图. IGT™ ssDNA Library Prep Kit试剂盒不同投入量的捕获数据表现
极高的胞嘧啶转化率
分别投入1ng、5 ng、20 ng cfDNA（样本为NA12878细胞系gDNA，超声打断模拟cfDNA）进行Bisulfite转化建库，使用123 kb的Panel进行捕获，NovaSeq 6000平台PE150测序，测序数据量平均为1.8 Gb。IGT™ ssDNA Library Prep Kit在文库构建时，采用Bisulfite法进行转化，胞嘧啶转化率在99.2%以上。
图. IGT™ ssDNA Library Prep Kit试剂盒不同投入量样本的转化率表现
DNA原始分子利用率高
样本为NA12878细胞系gDNA，分别投入5 ng、20 ng、50 ng、200 ng进行建库，其中5 ng、20 ng文库构建采用IGT™ ssDNA Library Prep Kit和IGT™ ssDNA Adapter & UDI Primer (for Illumina)，50 ng、200 ng文库构建采用IGT™ Methyl Fast Library Prep Kit v2.0和IGT™ Methyl Adapter & UDI Primer (for Illumina)，使用123 kb的Panel进行捕获，抽取1 Gb数据进行有效深度分析。在相同测序数据量下，单链建库的投入量仅为双链建库投入量的1/10，单链建库的去重后有效深度更高。
图. IGT™ ssDNA Library Prep Kit和双链DNA建库试剂盒的有效深度表现
