En

IGT™ ssDNA Library Prep Kit

/
试剂与仪器
/
IGT™ ssDNA Library Prep Kit
产品描述
产品描述
订购信息
相关下载

IGT™ ssDNA Library Prep Kit是一款通用型单链DNA建库试剂盒,可用于1 ng~50 ng DNA起始的甲基化文库和基因组文库构建,所构建的文库可进一步用于目标区域杂交捕获测序,或直接测序。在甲基化文库构建过程中,重亚硫酸盐处理会导致严重的DNA损伤、片段化、解链,另外,低质量或严重降解的DNA中也含有大量的DNA单链。IGT™ ssDNA Library Prep Kit可以对单链DNA进行接头连接,大幅提高DNA原始分子的利用率,提高文库的复杂性,在低起始量样本的甲基化文库和基因组文库构建中具有显著的优势。

产品特点


● 适合于cfDNA、FFPE DNA等低起始量样本,建库起始量可低至1 ng。

● 甲基化文库构建流程中,采用Post-BS建库策略,大幅提高DNA模板的利用率。

● 可有效提高文库复杂度,增加测序有效数据。

● 兼容全基因组甲基化测序、目标区域甲基化测序、全基因组测序和目标区域杂交捕获测序。

数据表现


适用于不同起始量样本,测序结果稳定

分别投入1 ng、5 ng、20 ng cfDNA(样本为NA12878细胞系gDNA,超声打断模拟cfDNA)进行单链建库,文库构建采用IGT™ ssDNA Library Prep Kit和IGT™ ssDNA Adapter & UDI Primer (for Illumina),使用123 kb的Panel进行捕获,NovaSeq 6000平台PE150测序,测序数据量平均为1.8 Gb。

图. IGT™ ssDNA Library Prep Kit试剂盒不同投入量的捕获数据表现

极高的胞嘧啶转化率

分别投入1ng、5 ng、20 ng cfDNA(样本为NA12878细胞系gDNA,超声打断模拟cfDNA)进行Bisulfite转化建库,使用123 kb的Panel进行捕获,NovaSeq 6000平台PE150测序,测序数据量平均为1.8 Gb。IGT™ ssDNA Library Prep Kit在文库构建时,采用Bisulfite法进行转化,胞嘧啶转化率在99.2%以上。

图. IGT™ ssDNA Library Prep Kit试剂盒不同投入量样本的转化率表现

DNA原始分子利用率高

样本为NA12878细胞系gDNA,分别投入5 ng、20 ng、50 ng、200 ng进行建库,其中5 ng、20 ng文库构建采用IGT™ ssDNA Library Prep Kit和IGT™ ssDNA Adapter & UDI Primer (for Illumina),50 ng、200 ng文库构建采用IGT™ Methyl Fast Library Prep Kit v2.0和IGT™ Methyl Adapter & UDI Primer (for Illumina),使用123 kb的Panel进行捕获,抽取1 Gb数据进行有效深度分析。在相同测序数据量下,单链建库的投入量仅为双链建库投入量的1/10,单链建库的去重后有效深度更高。

图. IGT™ ssDNA Library Prep Kit和双链DNA建库试剂盒的有效深度表现

如需采购,请联系当地客户经理。如果您对我们的产品有任何疑问,可以通过 ☍ 资源中心-技术支持联系我们。

版权所有: 艾吉泰康生物科技(北京)有限公司
SEO 网站建设: 中企动力 北京