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CGI甲基化Panel

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艾吉泰康基于自主研发的BisCap®甲基化捕获技术,推出甲基化捕获预定义探针产品BisCap® Human CpG Island Panel(简称 CGI Panel)。该试剂盒依据最新参考基因组GRCh38及补丁序列设计,Panel大小为21.2 Mb,覆盖27,000个CpG island,同时,补充覆盖13种已商业化应用于临床的甲基化标志物,可广泛应用于甲基化标志物筛选、肿瘤早筛、早检等方向。

产品特点


超高覆盖

● 覆盖27000个CpG Island,203万个CpG位点。

正负链+双态探针设计

● 针对正负链CG位点进行双态设计,可降低成本并保证甲基化检出率。

适合低起始量样本

● 自研单链建库试剂盒配合BisCap®杂交捕获试剂盒,更适合cfDNA检测,提高早筛数据有效性。

性能卓越

● 可实现单碱基分辨率,分析精准;捕获流程高度优化,性能指标优异 。

搭配BisCap®杂交捕获体系,在不同样本类型中均表现优异


样本为NA12878、FFPE DNA和cfDNA*(由NA12878打断模拟),分别投入5 ng、20 ng、50 ng、200 ng进行超声打断建库,其中5 ng、20 ng文库构建采用IGT™ ssDNA Library Prep Kit和IGT™ ssDNA Adapter & UDI Primer (for Illumina),50 ng、200 ng文库构建采用IGT™ Methyl Fast Library Prep Kit v2.0和IGT™ Methyl Adapter & UDI Primer (for Illumina),使用CGI Panel捕获,NovaSeq 6000平台PE150测序,测序数据量平均为8.6 Gb。

CGI Panel与WGBS相关性高


样本为NA12878,投入200 ng进行建库,文库构建采用IGT™ Methyl Fast Library Prep Kit v2.0和IGT™ Methyl Adapter & UDI Primer (for Illumina),NovaSeq 6000平台PE150测序。同时对预文库进行全基因组甲基化测序120 Gb和捕获后文库测序10 Gb,分析CGI Panel和WGBS中CpG位点的相关性。

图. BisCap® Human CpG Island Panel与WGBS的相关性比较

CGI Panel的重复性表现优异


样本为NA12878,投入200 ng进行建库,文库构建采用IGT™ Methyl Fast Library Prep Kit v2.0和IGT™ Methyl Adapter & UDI Primer (for Illumina),将相同预文库在不同捕获池中进行杂交捕获,NovaSeq 6000平台PE150测序10 Gb,分析同一样本在不同批次捕获实验中CpG位点的甲基化水平重复性。

图. BisCap® Human CpG Island Panel的重复性

建库可选试剂


ssDNA-UDI接头试剂盒

甲基化UDI接头试剂盒

杂交捕获可选试剂


TargetSeq One V2.0捕获试剂盒

通用封阻序列

捕获磁珠

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