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MultipSeq多重扩增子测序技术

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MultipSeq多重扩增子测序技术
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艾吉泰康MultipSeq®多重扩增子测序技术是一种将多重PCR反应与二代测序相结合的靶向捕获测序技术,基于热力学稳定性算法进行全基因组水平的特异性引物设计,结合艾吉泰康完善的panel优化流程,能快速高效实现目标区域的富集和测序,完成目标区域序列的检测。

技术流程


艾吉泰康MultipSeq®多重扩增子测序技术采用多重PCR反应技术,同时对多个目标区域进行扩增,得到扩增子产物,经过第1轮磁珠纯化后,进行接头PCR反应,将二代测序的接头序列引入到扩增子产物两侧,经过第2轮磁珠纯化,得到扩增子文库,对文库进行定量,质检和上机测序,最后通过生信分析,确定目标区域的碱基序列是否发生突变。

图. 多重PCR靶向捕获测序技术流程图

 

精准医学


2019年湖南大学湘雅医院的研究人员,发表在《Genetics in Medicine》杂志的一篇文章,报道了一个新的引发耳聋的基因突变ABCC1 C.1769A>G (p.Asn590Ser)。作者利用全外显子测序,在一个家系中发现了这个突变,并利用艾吉泰康MultipSeq®多重扩增子测序在大样本人群中进行验证,然后利用生理和分子实验证实该基因的生理功能和机理。

病原微生物鉴定


艾吉泰康MultipSeq®多重扩增子测序技术通过设计微生物耐药性基因特异性引物,针对目标区域进行高深度测序,与微生物全基因组/宏基因组测序相比,从根源上去除了非目标区域的数据,极大的提高了数据利用率,减小了生信分析的负担。与此同时,我们还可以将客户感兴趣的其他区域进行组合,如微生物鉴定、分型、溯源、进化分析、毒力因子检测等,一个Panel解决客户多样化的需求。

大众消费基因检测


大众消费基因检测主要围绕祖源分析及易感基因检测,其中与健康预防相关的易感基因检测在中国市场占据主导地位。艾吉泰康已经与国内外多个基因检测企业合作,累计开发数十个panel,为大众消费基因检测保驾护航。

动植物分子育种


艾吉泰康MultipSeq®多重扩增子测序技术,基于热力学模型进行引物设计,对植物基因组中编码的外显子序列进行覆盖,通过靶向捕获测序的方法简化目标作物基因组序列,极大的减少了冗余序列,并且降低了复杂植物研究对测序数据量的需求,因而可以更加精准和快速的进行品系鉴定、优势性状筛选、群体遗传性分析、种质亲缘关系分析等。

Panel设计 - 专家设计 • 全流程质控


搭配自主研发的专业多重引物设计质控软件,由技术背景深厚的国际知名专家指导设计。根据目标区域类型,分为单管和分管两种设计方式。

图:引物设计流程及策略示意图

优化方案 - 个性化 • 经验丰富


MultipSeq®多重扩增子技术采用均衡扩增能力强的反应体系进行第1轮多重PCR反应。根据实测数据中每个扩增产物的测序深度,使用深度学习的算法,调整优化引物,直到文库均一性的指标达到交付要求。

图. 优化前后各引物测序深度均一性指标

当gDNA起始量在10~200 ng范围时,MultipSeq®多重扩增子文库产物均满足上机要求,客户进行大样本量文库构建时,无需对gDNA的浓度进行均一性化处理。

图. 不同gDNA起始量构建的多重扩增子文库产物测序性能指标

 

艾吉泰康MultipSeq®多重扩增子测序技术开展定制产品的业务已有6年,定制流程成在熟,开发经验丰富,共开发定制产品1000余项,涉及遗传,肿瘤,免疫,微生物,法医,动植物育种等多个领域。MultipSeq®预定义检测试剂盒包含特异性引物池MultipSeq® Primer Pool及配套建库试剂盒MultipSeq® Library Prep Kit,MultipSeq® Indexed Primer试剂请按需搭配采购。

标准Panel产品


肿瘤方向产品

MultipSeq® BRCA1/2 Research Assay


免疫方向产品

MultipSeq® Human TCR Research Assay
MultipSeq® Human BCR Research Assay
MultipSeq® Human TCR-β Research Assay
MultipSeq® Mouse TCR Research Assay
MultipSeq® Mouse BCR Research Assay
MultipSeq® Rat BCR Research Assay


线粒体方向产品

MultipSeq® Human Mitochrondria Research Assay


微生物方向产品

MultipSeq® SARS-CoV-2 Research Assay

定制Panel产品


可选择全定制模式或基于现有标准产品进行半定制
了解更多请点击
  MultipSeq®多重扩增子试剂盒定制


肿瘤方向产品

CRISPR脱靶验证定制Panel


其他应用方向

动植物定制产品
法庭科学定制产品
古DNA定制产品

通用杂交捕获试剂


MultipSeq®建库试剂盒

MultipSeq® Library Prep Kit


MultipSeq®接头试剂盒

MultipSeq® CDI Primer (for Illumina)
MultipSeq® UDI Primer (for MGI)
MultipSeq® Dual-Indexed Primer


 

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