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TargetSeq杂交捕获测序技术

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TargetSeq杂交捕获测序技术
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技术优势
相关产品

艾吉泰康TargetSeq®杂交捕获测序技术是利用探针杂交的方式捕获目标区域,以检测肿瘤、遗传相关的变异信息。TargetSeq®基于多因素算法采用“叠瓦式”的探针设计方案,对目标区域进行多层探针设计。探针使用生物素标记的NTP和核酸类似物作为合成原料,制备出的特异性探针能够与目标基因组文库进行液相杂交,杂交完成后使用链霉亲和素磁珠来结合探针及目标区域文库的杂交产物,将捕获得到的目标区域文库富集后测序。

技术流程


TargetSeq®杂交捕获测序,首先需要构建一个完整的文库,然后将RNA探针与文库杂交形成RNA-DNA杂交产物,随后使用链霉亲和素标记的的磁珠捕获,经过洗脱非特异性结合的文库、纯化、扩增等步骤,得到特异性文库;最后对文库进行定量,片段质检,将质检合格的文库使用Illumina、MGI等二代测序平台进行高通量测序。

图. 艾吉泰康TargetSeq杂交捕获测序技术路线

 

艾吉泰康 TargetSeq® 杂交捕获测序技术目前已广泛应用于精准医学领域,致力于靶向捕获产品在肿瘤研究、用药筛选、遗传筛查、健康监测、免疫等方面的转化与应用。

肿瘤方向应用


研究人员通过药敏试验、基因筛选、细胞生物学实验等多种手段,发现在多种癌症(包括胆管癌)中抑癌基因PTEN的缺陷使肿瘤对蛋白酶体抑制剂敏感,为蛋白酶体抑制剂的抗癌治疗提供了精准用药的指导,该研究或将为PTEN突变肿瘤的治疗提供新的策略。

免疫方向应用


研究人员报道了一种存在于小鼠胚胎干细胞(mESCs)中的新型核酸抗病毒机制,它通过DNA介导的RNA裂解来抑制RNA病毒感染,是RNAi和CRISPR抗病毒机制之外又一种核酸依赖的抗病毒机制。

微生物方向应用


艾吉泰康于2020年2月份推出首款新冠病毒检测试剂盒,并在当年3月获取了两款新冠试剂盒的欧盟CE认证。艾吉泰康新冠病毒试剂盒广泛应用于北京大学、国家CDC、军队CDC等多个高等科研院所,并帮助完成了北京新发地新冠疫情的溯源研究。

大健康方向应用


艾吉泰康可根据解读区域定制特色WES产品。2021年12月24日,基云惠康和艾吉泰康联合开发的用于大健康检测的全外产品-基云惠康加强全外显子健康评估套餐升级版。

探针设计 - 3×叠瓦 • 灵活定制


基于热力学稳定性进行3×叠瓦式设计方案,目标区域覆盖度更好。

图. TargetSeq® 3×叠瓦式设计方案示意图和实测覆盖情况示例

根据序列GC含量、重复性、变异类型,灵活定制侧重于不同性能指标(覆盖率、均一性和捕获效率)需求的最优探针组合。

图. TargetSeq® 半定制探针设计方案覆盖度示意图

杂交捕获体系 - 操作简便 • 降低成本


一管操作,两种漂洗试剂,实验更简便的同时,性能更优越。

单杂、多杂、快杂多种方式可供选择,性能稳定,降低成本,节约时间。

图. TargetSeq One® 杂交捕获体系三种杂交方案性能指标

艾吉泰康可为研究人员提供杂交捕获流程中的探针panel产品、通用杂交捕获试剂盒、通用封阻序列、捕获磁珠等试剂,及自动化设备的一站式解决方案。艾吉泰康专注于探针杂交捕获技术,目前已完成800多款TargetSeq® Panel的开发,广泛应用于肿瘤检测、用药筛查、遗传筛查、分子育种、动植物进化等方向,不同大小、不同需求的定制探针产品数据指标均表现优异。

标准Panel产品


艾全外®人全外显子组系列产品

AIExome® Human Exome Panel V3
AIExome® Human Exome Panel V3 - Inherit


肿瘤方向产品

AIExome® Human Exome Panel V3 - Tumor
TargetSeq® Pan-Cancer Panel

TargetSeq® NCC Panel (113 Genes)
TargetSeq® NSCLC Panel (8 Genes)

TargetSeq® HRD Panel
TargetSeq® HRR Panel
TargetSeq® Hema Tumor Fusion RNA Panel


免疫方向产品

TargetSeq® Human HLA Panel
TargetSeq® Human MHC Panel


线粒体方向产品

TargetSeq® Human Mitochrondrial Panel


微生物方向产品

TargetSeq® SARS-Cov-2 Panel
TargetSeq® HBV Panel
TargetSeq® EBV Panel

定制Panel产品


标准产品PLUS定制区域
了解更多请点击  TargetSeq®杂交捕获试剂盒定制


肿瘤方向产品

CRISPR脱靶验证定制Panel


其他应用方向

动植物定制产品
古DNA定制产品

通用杂交捕获试剂


TargetSeq One®杂交捕获体系

TargetSeq One® Hyb & Wash Kit v2.0


通用封阻试剂

TargetSeq® Universal Blocking Oligo
TargetSeq® Eco Universal Blocking Oligo


捕获磁珠

TargetSeq® Cap Beads & Nuclease-Free Water


 

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