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IGT™ UMI Adapter & UDI Primer (for MGI)

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IGT™ UMI Adapter & UDI Primer (for MGI)
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数据表现
订购信息

IGT™ UMI Adapter & UDI Primer (for MGI)包括双端UMI接头Mix和UDI引物。双端UMI接头Mix由64种固定的UMI接头混合而成,长度为6 bp,可产生4096种组合UMI,其多样性足以区分原始DNA分子。UMI序列之间的编辑距离≥3,可以更准确地矫正DNA分子在文库构建、目标区域捕获和测序过程中产生的错误。接头两端各带唯一的Index(UDI),可以交叉检验,降低Index错配干扰。IGT™ UMI Adapter & UDI Primer (for MGI)可用于肿瘤、无创产前、病原微生物和古DNA等领域的低频变异检测。

检测原理


制备连接UMI接头的cfDNA文库(图1),结合液相探针杂交捕获技术,可定向富集并完成对目标区域的高深度测序。测序数据经过分子标签校正,可过滤掉PCR扩增错误、测序错误等“背景噪音”,找到真实变异位点(图2)。

图1. IGT™ UMI Adapter & UDI Primer (for MGI)搭配艾吉泰康®低起始量文库构建试剂盒(Ulti Library Prep Kit)建库流程

图2. 双端UMI矫正数据错误原理

产品优势


1. 超高的接头连接效率:优化接头设计和合成过程,保证高文库转化效率,高灵敏度检出低频变异;
2. 独特的UMI序列设计方式:采用非随机的UMI序列设计(编辑距离≥3),避免因UMI序列扩增和测序错误引入的假阳性变异;
3. 辅助实现低频变异的准确检测:准确检测低至0.01%的低频变异。通过双端UMI矫正可过滤掉99.9%的背景噪音;
4. 搭配双端唯一分样序列 (Unique Dual Index, UDI),极大程度避免交叉污染;
5. 配合艾吉泰康®自主知识产权的探针设计,实现定制化的cfDNA靶标区域检测。

检测案例:菁良基因0.1% cfDNA参考标准品测序


样品:菁良基因肺癌cfDNA参考标准品(GW-OCTM009)
数据表现:投入30 ng变异等位基因频率为0.1%的cfDNA 标准品建库捕获,平均测序深度>20000×条件下,已知8个变异位点均能检出,且检测频率接近预期频率。灵敏度和特异性均为100%。(表1)

表1 菁良基因0.1% cfDNA参考标准品已知位点检出情况

突变位点 预期变异频率 总深度 变异深度 实际变异频率
EGFR L858R 0.1% 5810 8 0.14%
EGFR T790M 0.1% 6353 6 0.09%
EGFR V769_D770insASV 0.1% 6524 6 0.09%
EGFR ΔE746_A750 0.1% 5765 4 0.07%
KRAS A146T 0.1% 6863 6 0.09%
KRAS G12D 0.1% 6860 8 0.12%
NRAS Q61K 0.1% 7051 6 0.09%
PIK3CA E545K 0.1% 7620 13 0.17%

*特异性根据基因组上其他指定位置的碱基检测结果计算。

试剂盒名称 规格 货号
Insert UMI kit (for MGI) 5 rxn TINUD-B05
Insert UMI kit (for MGI) 16 rxn TINUD-B16
Insert UMI kit (for MGI) 96 rxn TINUD-B96
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