En

IGT™ Adapter & UDI Primer (for MGI)

iGeneTech

/
试剂与仪器
/
IGT™ Adapter & UDI Primer (for MGI)
产品描述
产品详细
数据表现
订购信息

IGT™ Adapter & UDI Primer (for MGI)是艾吉泰康®独家专利设计的适用于MGI平台的双端唯一标签接头模块。该产品包含MGI平台通用接头以及384种双端唯一10 nt Index,能够满足MGI平台单条lane超高数据产量的混样需求。 
MGI平台独特的DNB技术采用线性扩增工艺,可显著降低标签跳跃(Index Hopping)比例。但在低频突变检测、低丰度病原检测等应用场景下,对防止数据串扰有更高的要求。UDI的引入能够最大程度地避免Index Hopping带来的样本之间数据串扰。

图1. 艾吉泰康®Fast Library Prep Kit搭配IGT™ Adapter & UDI Primer (for MGI)构建文库流程图

 

均一、稳定的文库产量

IGT™ Adapter & UDI Primer (for MGI)与Illumina®平台对应产品在相同实验条件下的平均文库产量基本一致(图1)。各UDI的独立扩增效率同样具有有效保证(图2)。

图1. IGT™ Adapter & UDI Primer (for MGI)与IGT™ Adapter & UDI Primer (for Illumina)文库产量对比图。实验流程按照对应的DNA投入量和PCR循环数进行,搭配艾吉泰康®Fast Library Prep Kit完成,各组随机抽取两平台 1-384 种UDI中的 25 种进行文库构建测试(各组间UDI不重复使用)。

图 2. IGT™ Adapter & UDI Primer (for MGI)独立扩增效率展示图。选取UDI-1~UDI-48、UDI-97~UDI-144,各反应投入50 ng gDNA标准品,使用艾吉泰康®Fast Library Prep Kit扩增7个循环,平均文库产出达约1900 ng。

均一的有效拆分率和数据产出

IGT™ Adapter & UDI Primer (for MGI)设计原则中,Index序列连续碱基≤2,编辑距离≥3。并以8组Index作为碱基平衡的单元,表示只要有至少8个样本安排在同一条lane中时,即可连续使用。这对于当下主流MGI平台的测序产量来说,无疑是行之有效的。此外,多个样本混合在一条lane中测序时,各UDI之间能够保持基本一致的有效拆分率(图3),从而保证样本之间数据产出的均一度。

图3. 48种UDI有效拆分率展示图。选取UDI-1~UDI-48,各反应投入50 ng gDNA标准品,使用艾吉泰康®Fast Library Prep Kit扩增7个循环构建WGS文库上机测序,测序平台选取MGISEQ-2000,测序模式为PE150。

降低标签错配污染,提升数据准确度

MGI平台凭借独特的DNA纳米球(DNB)技术使得Index Hoping比例显著降低,但并不能完全避免。以人工合成的96条不同序列为模板,构建对应于96对不同UDI引物的文库,分别安排16、48和96个文库分lane测序,以评估index之间的交叉污染。分析数据显示所有UDI均可正确拆分,且正确拆分比例>99.9%(图4)。 除此之外,使用UDI分样可有效减少产生Index Hoping的reads(Index 1 和 Index 2 匹配到不同的 UDI)进入后续分析流程,极大程度地避免数据串扰,提高数据准确度。

图4. UDI文库标签错配分析图。使用艾吉泰康®Fast Library Prep Kit构建96个不同UDI的WGS文库,分别安排16、48、96个文库分lane测序,测序平台选取MGISEQ-2000,测序模式为PE150。

 

试剂盒名称 规格 货号
Ada & Index Kit (UDI for MGI) 5 rxn TIUDI-B05
Ada & Index Kit (UDI for MGI) 16 rxn TIUDI-B16
Ada & Index Kit (UDI for MGI) 96 rxn TIUDI-B96
版权所有: 艾吉泰康生物科技(北京)有限公司
SEO 网站建设: 中企动力 北京