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AnchorSeq锚定多重扩增子测序技术

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AnchorSeq锚定多重扩增子测序技术
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艾吉泰康AnchorSeq™锚定多重扩增子测序技术是一种将锚定多重PCR反应与二代测序相结合的靶向捕获测序技术,可以利用5'端锚定引物及多重聚合酶链反应(PCR)技术高效、特异性扩增核酸片段,实现对cfDNA样本低频突变与融合事件的有效检测。

技术流程


AnchorSeq™锚定多重扩增子测序技术以cfDNA为模板,将双链cfDNA进行末端修复和接头序列的连接;对连接上述接头序列的产物进行线性扩增反应;对扩增产物进行第两轮半巢式扩增,得到目标区域;进行Post-PCR扩增构建完整的上机文库;最后对文库进行定量,质检和上机测序。通过高深度测序与UMI分析,可稳定检测出丰度≥0.02%的ctDNA。

图. AnchorSeq™锚定多重扩增子测序技术流程图

AnchorSeq™肿瘤MRD检测应用


  • 评估复发风险: 早于传统影像学,是一个优良的预后标记物。
  • 疗效预测: 协助判断术后化疗、靶向治疗、免疫治疗等辅助治疗的必要性,为
  • 判断预后以及制定进一步的治疗方案提供依据。
  • 药物假期: MRD是判断患者是否能够进入药物假期的标准之一。
  • 判断患者体内的肿瘤负荷: MRD检测阴性,代表患者体内的肿瘤负荷较低较小,甚至无肿瘤细胞;MRD检测阳性,代表患者体内仍有残留的肿瘤细胞。

图. 癌症患者肿瘤负荷的动态变化对诊疗策略的影响

AnchorSeq™肿瘤ctDNA-MRD个体化监测方案


AnchorSeq™技术定制内容请点击 ☍ AnchorSeq™锚定多重扩增子试剂盒定制

引物设计 - 单引物特异性延伸


AnchorSeq™锚定多重扩增子技术原理为单引物特异性延伸法,锚定引物预先结合在模板分子一端,只需单条特异性引物结合即可扩增模板分子,可有效提高接头连接效率,充分保证模板的利用率。

图. AnchorSeq™锚定多重扩增子技术原理示意图

整体解决方案 - 低频突变检测


搭配AnchorSeq™ Library Prep Kit和AnchorSeq™ UMI Adapter & UDI Primer接头引物,双侧验证,有效避免样本数据串扰;通过接头连接引入UMI接头,降低背景噪音,可以稳定检出丰度低至0.02%的ctDNA分子。

图. A:10 ng和50 ng低起始量建库平均测序深度比较。B:AnchorSeq™锚定多重扩增子技术原理示意图

AnchorSeq™锚定多重扩增子实验流程需要搭配AcnhorSeq特异性引物池、AnchorSeq建库试剂、AnchorSeq接头试剂和纯化磁珠使用。AnchorSeq™ Primer Pool 为 AnchorSeq™锚定多重扩增子文库构建实验流程中使用的特异性引物池,构建不同目标区域扩增子需要使用不同的AnchorSeq™ Primer Pool。AnchorSeq™接头试剂包含适配不同测序平台的版本,请按需选择。

定制Panel产品


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通用建库试剂


AnchorSeq™建库试剂盒

AnchorSeq™ Library Prep Kit


AnchorSeq™接头试剂盒

AnchorSeq™ UMI Adapter & UDI Primer


 

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