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在法医物证领域,法医工作者主要通过检测与分析DNA遗传标记,实现个体识别与亲缘关系鉴定。DNA遗传标记主要分为DNA长度多态性标记(如短串联重复序列STR)和DNA序列多态性标记(如SNP)。法医DNA遗传标记的多重扩增子靶向捕获测序解决方案通过多重PCR反应,同时对数百个SNP和STR遗传标记进行扩增和富集,得到扩增子文库,经过测序和生信分析后,得到SNP位点的基因型结果和STR重复的次数,实现个体识别与亲缘关系鉴定的目的。

产品优势


DNA分子标记类型

SNP, STR,mtDNA等

单个反应检测
分子标记个数

2000个以下

扩增产物长度

1. gDNA完整度较高样本,扩增产物长度范围为160-300bp
2. gDNA高度片段化样本,扩增产物长度范围为80-160bp

检测样本类型

血片,唾液,血液,口腔拭子,精液,骨骼等常见法医检材

gDNA起始量

1. STR和SNP位点:最低起始量为100pg,推荐起始量500pg以上
2. MtDNA:最低起始量50pg,推荐起始量200pg以上
3. 支持血片直扩(血片孔径1mm)

文库构建周期和通量

1. 人工构建:96个样本/6.5h/单人
2. 支持自动化工作站,每天的通量可以达到数千个,主要由工作站数量决定

测序平台和读长

1. illumina测序平台,测序读长选择PE300
2. MGI测序平台,测序读长选择SE400

检测突变灵敏度

检测突变频率的灵敏度为1%

定制试剂盒开发周期

25个工作日

产品应用


截止到2021年12月,艾吉泰康与国内多家法医研究单位,院校和公司合作,共计开发近30款应用于法医DNA分子标记检测的多重PCR靶向捕获测序试剂盒,检测结果均取得了客户满意的效果。部分试剂盒的数据指标如表2所示,性能指标均达到行业领先水平。


表2 11款DNA分子标记多重PCR靶向捕获测序测序试剂盒的性能指标

Panel名称 多重反应重数 gDNA起始量 原始数据(Mb) 数据有效率(%) 数据对比率(%) 数据捕获率(%) 1X测序深度覆盖率(%) 平均测序深度 30X测序深度的覆盖率(%) 20%平均测序深度的覆盖率(%)
Panel1 120 1 ng 145.11 97.3 99.16 88.08 100 5126.41 99.13 97.48
Panel2 164 10 ng 374.09 90.77 91.64 82.35 99.88 5170.74 99.81 96.66
Panel3 754 5 ng 297.85 83.03 88.52 40.07 99.74 926.01 99.48 98.32
Panel4 371 5 ng 224.53 98.25 99.42 99.5 100 2709.97 99.99 99.05
Panel5 859 5 ng 718.79 57.81 52.33 94.56 99.66 2633.6 99.34 96.36
Panel6 214 5 ng 95.72 98.99 99.74 99.48 99.8 2682.18 99.83 98.11
Panel7 210 5 ng 306.95 96.93 97.85 98.66 99.12 6545.39 98.76 95.56
Panel8 192 1 ng 354.12 75.01 70.47 95.84 99.22 4948.24 99.21 97.21
Panel9 197 1 ng 38.83 83.88 98.18 99.32 99.79 823.84 98.36 96.33
Panel10 19 100 pg 19.51 88.12 98.79 92.59 100 3617.62 99.11 98.15
Panel11 131 10 ng 49.81 92.90 98.81 97.95 99.73 2717.76 99.72 98.11

 

截止到2021年12月,艾吉泰康与国内多家法医研究单位,院校和公司合作,共计开发近30款应用于法医DNA分子标记检测的多重PCR靶向捕获测序试剂盒,检测结果均取得了客户满意的效果。部分试剂盒的数据指标如表2所示,性能指标均达到行业领先水平。

表1 11款DNA分子标记多重PCR靶向捕获测序试剂盒的性能指标

panel
名称

多重反应重数

gDNA起始量

原始数据(Mb)

数据有效率(%)

数据比对率(%)

数据捕获率(%)

1X 测序深度覆盖率(%)

平均测序深度

30X测序深度的覆盖率(%)

20%平均测序深度的覆盖率(%)

Panel 1

120

1ng

145.11

97.3

99.16

88.08

100

5126.41

99.13

97.48

Panel 2

164

10ng

374.09

90.77

91.64

82.35

99.88

5170.74

99.81

96.66

Panel 3

754

5ng

297.85

83.03

88.52

40.07

99.74

926.01

99.48

98.32

Panel 4

371

5ng

224.53

98.25

99.42

99.5

100

2709.97

99.99

99.05

Panel 5

859

5ng

718.79

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52.33

94.56

99.66

2633.6

99.34

96.36

Panel 6

214

5ng

95.72

98.99

99.74

99.48

99.83

2682.18

99.83

98.11

Panel 7

210

5ng

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Panel 8

192

1ng

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Panel 9

197

1ng

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Panel 10

19

100pg

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100

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98.15

Panel 11

131

10ng

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97.95

99.73

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99.72

98.11

 

 

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