En

HLA&MHC

iGeneTech

/
产品与应用
/
HLA&MHC
产品描述
产品描述
数据表现
订购信息
相关下载
常见问题

HLA(human leukocyte antigen ,人类白细胞抗原)是人类的主要组织相容性复合体(MHC)的表达产物,该系统是所知人体最复杂的多态系统,是控制细胞间相互识别,调节免疫应答的一组紧密连锁基因群。iGeneTech基于自主研发的TargetSeq液相杂交捕获技术,针对该多态性区域高效捕获,结合NGS测序方法得到HLA 6位高精度分型结果。

 

第1区域:等位基因组

第2区域:特定HLA蛋白

第3区域:编码区同义突变

第4区域:非编码区突变

产品内容


 

产品名称

Panel大小

检测范围

分析内容

AI-HLA-Cap

16.67 Kb

HLA-A、B、C基因全长,HLA-DRB1、DPB1、DQB1基因全外显子区域

基因分型

AI-MHC-Cap

5 Mb

HLA基因全长

SNP、InDel、基因分型

产品优势


1. 分辨率高:实现6位高精度分型;
2. 设计严谨:探针对目标区域实现高覆盖;
3. 准确度高:基于NGS测序方法,避免模棱两可的结果;
4. 灵活定制:可基于实际需求,定制客户专属的HLA检测产品。

应用方向


 

1. HLA Panel 可以实现6位的高精度基因分型
采样编号 样本编号 A B C
NS132-RDSTG06-RDSTG074-T216V1-190718-HJJ-index53-6-cap6 NS132-RDSTG06-RDSTG074-T216V1-190718-HJJ-index53-6-cap6

A*02:01:01

A*01:01:01

B*08:01:01

B*35:32:02

C*07:01:01

C*04:01:01

采样编号 样本编号 DQB1 DPB1 DRB1
NS132-RDSTG06-RDSTG06-RDSTG074-T216V1-190718-HJJ-index53-6-cap6 NS132-RDSTG06-RDSTG074-T216V1-190718-HJJ-index53-6-cap6

DQB1*02:01:01G

DQB1*05:01:01

DPB1*04:01:01

DPB1*03:01:01

DRB*03:01:01G

DRB1*07:01:01

图1. HLA分型报告中展示的6位分型结果。利用 AI-HLA-Cap Panel对标准品进行靶向富集后,进行PE150测序,使用 HLA-HD 分析软件进行分型分析。HLA分型结果与PCR-SBT结果进行对比,准确率高达 100%。


2. MHC Panel 采用酶切建库法实现对MHC区域的高覆盖和有效富集

样本类型 Coverage rate(%) Target Reads capture rate(%) Target mean depth T 20X coverage rate(%) TC 20%X coverage rate(%)
gDNA 97.27 77.27 189.71 91.80 90.38
gDNA 97.31 78.01 166.05 91.43 90.50

200X平均测序深度下,覆盖度>97%,均一性(TC 20%X coverage rate)>90%,捕获效率>77%。

试剂盒名称 规格 货号
AI-HLA-Cap 16 rxn / 96 rxn AIHLC
AI-MHC-Cap 16 rxn / 96 rxn AIMHC

1. 艾吉泰康HLA/MHC产品区别是什么?
HLA Panel参考IMGT/HLA数据库进行设计,包括I类 - A、B、C基因全长,II类 - DRB1、DQB1、DPB1全外显子区域;MHC Panel包含了人6号染色体短臂6p21.3上HLA全长,可支持不同研究目的个性化定制服务。


2. HLA分型建议测序深度是多少?
HLA分型建议深度在1000X以上,可以实现6位的高精度基因分型,并且还可以发现新发突变。 


3. HLA分型二代测序和一代PCR-SBT的区别?
尽管一代测序PCR-SBT法是推荐 HLA 分型检测的公认方法,但面临通量低以及分型过程存在模糊指定的问题。NGS 检测深度更高,范围更广,进行HLA基因分型检测分辨率高、特异性强、通量高、单次分型即可完成高分辨率 HLA 分型。
 

上一个
下一个
版权所有: 艾吉泰康生物科技(北京)有限公司
SEO 网站建设: 中企动力 北京