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乙型肝炎病毒(HBV)是引起乙型肝炎(简称乙肝)的病原体,属于嗜肝DNA病毒科成员,共有8种亚型,目前仍然是威胁人类健康的重要传染病之一。
基于TargetSeq®液相探针杂交捕获技术研发乙肝病毒(HBV)检测试剂盒(AI-HBV-Cap Enrichment Kit),可一次性分析HBV分型、HBV突变位点检测和HBV与宿主基因组整合位点分析。以HBV感染样本提取的gDNA为模板,进行文库构建,通过探针特异性富集HBV病毒序列,经过高通量测序与生信分析后,实现上述检测目标。对于阐明与病毒相关的肿瘤发生发展机制具有重要的科学意义。

产品特点


检测亚型 探针覆盖HBV病毒的8种亚型,共5500种病毒株
探针条数 3089
覆盖区域 17.6 M
实验环节 1. 样本类型:组织,细胞,血浆等
2. 病毒含量:Ct值低于32
3. 探针杂交捕获方式:2轮探针杂交
4. 文库构建周期:96样本/3天
测序环节 1. 支持illumina和MGI测序平台
2. 测序方式:PE150
3. 测序数据量:建议2G
数据分析结果 1. 病毒组装为contig
2. 病毒分型
3. 病毒突变位点分析
4. 病毒与宿主基因组融合位点分析

技术路线


1. 采用酶切法或机械打断法对gDNA进行片段化处理,然后通过末端修复,接头连接和文库扩增得到含有病毒与宿主基因组序列的文库(图1)。
2. 在探针杂交环节,先使用探针与文库进行第1轮杂交捕获,初步富集含有HBV病毒序列的文库。
3. 使用探针与上述文库进行第2轮杂交捕获,进一步富集含有HBV序列的文库后,经过定量和质检,进行高通量测序。

图1. HBV病毒全基因组两轮探针杂交捕获流程示意图

发表文章


截止目前,国内多家HBV病毒研究机构已经使用过本试剂盒开展HBV病毒突变位点分析和融合位点检测,均取得不错的研究结果,相应研究成果发表的文章如下。
1. Yu F, Zhang X, Tian S, et al. Comprehensive investigation of cytokine-and immune-related gene variants in HBV-associated hepatocellular carcinoma patients[J]. Bioscience reports, 2017, 37(6): BSR20171263.(IF=2.9)
2. Rui Pu, Wenbin Liu, Xinyu Zhou, et al.  The Effects and Underlying Mechanisms of Hepatitis B Virus X Gene Mutants on the Development of Hepatocellular Carcinoma. Research Square, 2021.

试剂盒名称 规格 货号
AI-HBV-Cap Enrichment Kit 16 rxn / 96 rxn AIHBC
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