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产品简介


AI-HRD-Cap是艾吉泰康基于自主研发的液相探针目标区域捕获技术专门打造的HRD评分试剂盒,适配于目前主流的高通量测序平台。本产品基于中国人群遗传背景设计,可准确计算LOH、TAI和LST三种基因组不稳定性指标,助力筛选铂类和PRAP抑制剂获益人群,为卵巢癌、乳腺癌、前列腺癌等多种实体瘤患者提供用药指导。AI-HRD-Cap是艾吉泰康基于自主研发的液相探针目标区域捕获技术专门打造的HRD评分试剂盒,适配于目前主流的高通量测序平台。本产品基于中国人群遗传背景设计,可准确计算LOH、TAI和LST三种基因组不稳定性指标,助力筛选铂类和PRAP抑制剂获益人群,为卵巢癌、乳腺癌、前列腺癌等多种实体瘤患者提供用药指导。

iGeneTech

产品优势


基于中国人群遗传背景以及疗效数据开发的适合中国人群的HRD检测产品;
价格优势:中国制造品牌,标准自动化制备工艺,有效降低成本;
灵活定制:可按照客户需求灵活增加基因/位点;
适用人群广泛:初治/复发的乳腺癌、卵巢癌、前列腺癌、胰腺癌、膀胱癌等实体瘤患者。

产品应用


指导PARP抑制剂的使用;
预测铂类药物疗效;
评估乳腺癌、卵巢癌等家族遗传风险。

产品参数


试剂盒名称 HRD HRR
目标区域大小 4 Mb 177.91 kb
技术原理 TargetSeq®杂交捕获测序技术 TargetSeq®杂交捕获测序技术
产品内容 3.7SNP位点——用于计算三种基因组瘢痕现象(LOHTAILST 包括BRCA1/2基因在内的HRR核心39基因panel

1.数据表现优异

Sample Raw bases(Mb) Clean bases(Mb) Target mean depth Target reads mapping rate(%) Target duplication rate(%) Target reads capture rate(%) T 20%X coverage rate(%) 备注
Sample1 4043.32 3647.84 375.13 98.9 19.77 81.93 95.11 HRD评分试剂盒
Sample2 3483.55 3163.43 322.58 98.96 18.91 81.47 95.43
Sample3 279.67 254.46 650.55 99.49 21.21 71.82 98.31 HRR核心39基因试剂盒
Sample4 277.13 252.84 665.24 99.59 21.11 73.94 98.51

表1. 两个试剂盒gDNA标准品数据表现。投入200 ng gDNA标准品样本建库,液相杂交捕获后使用NovaSeq 6000进行测序。试剂盒数据稳定,捕获效率、覆盖度和均一性等表现优异。
 
2. HRD score与HRR基因变异情况趋势一致。

Sample LOH  LST TAI HRD-score HRR基因突变
Sample1 8 21 12 41 胚系意义不明
Sample2 3 2 3 8 胚系、体系意义不明
Sample3 9 14 25 48 体系可能有害
Sample4 24 31 27 82 胚系、体系致病
Sample5 4 10 7 21 胚系意义不明
Sample6 33 32 27 92 体系有害

表2. 两个试剂盒对于6例肿瘤组织样本的测试结果。选择6例肿瘤组织样本计算HRD score,同时统计HRR基因变异情况。结果显示,HRD score与HRR基因变异情况趋势一致,初步表明HRD评分试剂盒可准确用于HRD的检测。

 

 

试剂盒名称 规格 货号
AI-HRD-Cap 16 rxn / 96 rxn AIHRC
AI-HRR-Cap 16 rxn / 96 rxn AIHRR

1. 艾吉泰康HRR/HRD产品区别是什么?
艾吉泰康AI-HRR-Cap 产品包括BRCA1/2基因在内的HRR核心39基因Panel,用于HRR通路基因突变检测。另外,除 HRR相关基因发生突变或启动子发生甲基化外,其他暂未明确的原因等都会引起同源重组缺陷-HRD,导致基因组不稳定,表现为“基因组瘢痕”,艾吉泰康AI-HRD-Cap 产品中包含3.7万SNP位点,用于计算包括LOH (基因组杂合性缺失)、TAI(端粒等位基因不平衡)、LST(大片段迁移)三种基因组瘢痕现象评分。但是,由于HRD状态是存在个体化差异的,是非标准化的,因此现在市面上的HRD检测产品都会包含HRR基因变异检测和基因组瘢痕检测两大部分。


2. 样本肿瘤纯度是否对HRD分值检测产生影响?
会的,艾吉泰康的HRD分析流程中会对肿瘤纯度进行分析,如果肿瘤纯度过低会影响分值检测的准确性,建议样本肿瘤纯度≥30%。


3. 艾吉泰康HRD/HRR产品测序深度建议多少,是否可以混合使用?
HRD建议深度200X以上,HRR建议500X以上;两款产品可以同时捕获,艾吉泰康也推出HRD+HRR探针,深度比可达1:2.5;并且HRD Panel也支持与WES或其他定制产品合并检测。在艾全外®V3肿瘤版中,我们专门添加了HRD检测骨架,可以满足一测多得需求。


4. HRD检测是否需要对照样本,对照样本建议测序深度是多少?
HRD检测的是存在同源重组缺陷的肿瘤细胞,需成对样本送样,血液样本做对照,血液样本建议测序深度100X以上。

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