HRD Panel和HRR Panel

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产品与应用

HRD Panel和HRR Panel

艾吉泰康^®基于TargetSeq^®杂交捕获测序技术，依托MGI、Illumina两大高通量测序平台，推出TargetSeq^® HRD Panel和TargetSeq^® HRR Panel产品。其中，TargetSeq^® HRR Panel产品囊括39个HRR核心基因，用于HRR通路基因突变的检测；TargetSeq^® HRD Panel产品囊括37,000个SNP位点，用于计算LOH（基因组杂合性缺失）、TAI（端粒等位基因不平衡）、LST（大片段迁移）三种基因组瘢痕指标，得出HRD score，评估HRD状态。同时，艾吉泰康^®TargetSeq^® HRD Panel和TargetSeq^® HRR Panel可以叠加使用，用于评估HRD状态以及检测HRR基因突变。

产品特点

全面检测

● TargetSeq^® HRD Panel根据中国人群遗传背景和疗效数据库设计37,000个SNP位点，能有效覆盖人的全基因组序列，用于LOH、TAI、LST的精准计算。TargetSeq^®HRR Panel根据最新NCCN指南、肿瘤药物临床试验、顶级科研成果设计并筛选出与HRR通路最相关的39个核心基因。

性能卓越

● 1500+高标准个性化定制的基因捕获产品设计经验，为满足客户个性化需求提供多种解决方案。艾吉泰康^®自主研发的TargetSeq One^® Hyb & Wash Kit v2.0捕获体系，数据表现稳定、优异，并可适配MGI、Illumina双测序平台。

灵活定制

● 可与艾吉泰康^®其他Panel（如艾全外^®V3人全外显子组）联合使用；也可根据客户需求灵活设计补充区域，定制客户专属的HRD检测Panel。了解更多请点击 ☍ TargetSeq^®杂交捕获试剂盒定制。

性价比高

● 中国质造品牌，标准自动化制备工艺，超高性价比。

数据表现优异

投入200 ng gDNA标准品，使用TargetSeq^® HRD Panel和TargetSeq^® HRR Panel试剂盒进行建库和杂交捕获，Illumina NovaSeq 6000 PE150测序。

表1.TargetSeq^® HRD Panel和TargetSeq^® HRR Panel标准品数据质控

Panel	Sample	Raw bases(Mb)	Clean bases(Mb)	Target mean depth	Target reads mapping rate(%)	Target duplication rate(%)	Target reads capture rate(%)	T 20%X coverage rate（%）
TragetSeq^® HRD Panel	Sample1	4043.32	3647.84	375.13	98.9	19.77	81.93	95.11
TragetSeq^® HRD Panel	Sample2	3483.55	3163.43	322.58	98.96	18.91	81.47	95.43
TragetSeq^® HRR Panel	Sample3	279.67	254.46	650.55	99.49	21.21	71.82	98.31
TragetSeq^® HRR Panel	Sample4	277.13	252.84	665.24	99.59	21.11	73.94	98.51

HRD score与HRR基因变异情况趋势一致

艾吉泰康使用自研HRD分析流程对140例卵巢癌及乳腺癌临床样本实测数据建立HRD，score模型，并确定了HRD阳性阈值。选择6例不同肿瘤组织样本利用该阈值计算HRD，score，同时统计HRR基因变异情况。结果显示，HRD，score与HRR基因变异情况趋势一致，初步表明HRD评分试剂盒可准确用于HRD的检测。

表2. TargetSeq^® HRD Panel和TargetSeq^® HRR Panel在不同肿瘤组织样本中的测试结果

Sample	LOH	LST	TAI	HRD-score	HRR基因突变
Sample1	8	21	12	41	胚系意义不明
Sample2	3	2	3	8	胚系、体系意义不明
Sample3	9	14	25	48	体系可能有害
Sample4	24	31	27	82	胚系、体系致病
Sample5	4	10	7	21	胚系意义不明
Sample6	33	32	27	92	体系有害