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HRD Panel和HRR Panel

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HRD Panel和HRR Panel
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艾吉泰康®基于TargetSeq®杂交捕获测序技术,依托MGI、Illumina两大高通量测序平台,推出TargetSeq® HRD Panel和TargetSeq® HRR Panel产品。其中,TargetSeq® HRR Panel产品囊括39个HRR核心基因,用于HRR通路基因突变的检测;TargetSeq® HRD Panel产品囊括37,000个SNP位点,用于计算LOH(基因组杂合性缺失)、TAI(端粒等位基因不平衡)、LST(大片段迁移)三种基因组瘢痕指标,得出HRD score,评估HRD状态。同时,艾吉泰康®TargetSeq® HRD Panel和TargetSeq® HRR Panel可以叠加使用,用于评估HRD状态以及检测HRR基因突变。

产品特点


全面检测

● TargetSeq® HRD Panel根据中国人群遗传背景和疗效数据库设计37,000个SNP位点,能有效覆盖人的全基因组序列,用于LOH、TAI、LST的精准计算。TargetSeq® HRR Panel根据最新NCCN指南、肿瘤药物临床试验、顶级科研成果设计并筛选出与HRR通路最相关的39个核心基因。

性能卓越

● 1500+高标准个性化定制的基因捕获产品设计经验,为满足客户个性化需求提供多种解决方案。艾吉泰康®自主研发的TargetSeq One® Hyb & Wash Kit v2.0捕获体系,数据表现稳定、优异,并可适配MGI、Illumina双测序平台。

灵活定制

● 可与艾吉泰康®其他Panel(如艾全外®V3人全外显子组)联合使用;也可根据客户需求灵活设计补充区域,定制客户专属的HRD检测Panel。了解更多请点击 ☍ TargetSeq®杂交捕获试剂盒定制

性价比高

● 中国质造品牌,标准自动化制备工艺,超高性价比。
 

数据表现优异


投入200 ng gDNA标准品,使用TargetSeq® HRD Panel和TargetSeq® HRR Panel试剂盒进行建库和杂交捕获,Illumina NovaSeq 6000 PE150测序。

表1.TargetSeq® HRD Panel和TargetSeq® HRR Panel标准品数据质控

Panel Sample Raw bases(Mb) Clean bases(Mb) Target mean depth Target reads mapping rate(%) Target duplication rate(%) Target reads capture rate(%) T 20%X coverage rate(%)
TragetSeq® HRD Panel Sample1 4043.32 3647.84 375.13 98.9 19.77 81.93 95.11
Sample2 3483.55 3163.43 322.58 98.96 18.91 81.47 95.43
TragetSeq® HRR Panel Sample3 279.67 254.46 650.55 99.49 21.21 71.82 98.31
Sample4 277.13 252.84 665.24 99.59 21.11 73.94 98.51

HRD score与HRR基因变异情况趋势一致


艾吉泰康使用自研HRD分析流程对140例卵巢癌及乳腺癌临床样本实测数据建立HRD,score模型,并确定了HRD阳性阈值。选择6例不同肿瘤组织样本利用该阈值计算HRD,score,同时统计HRR基因变异情况。结果显示,HRD,score与HRR基因变异情况趋势一致,初步表明HRD评分试剂盒可准确用于HRD的检测。

表2. TargetSeq® HRD Panel和TargetSeq® HRR Panel在不同肿瘤组织样本中的测试结果

Sample LOH  LST TAI HRD-score HRR基因突变
Sample1 8 21 12 41 胚系意义不明
Sample2 3 2 3 8 胚系、体系意义不明
Sample3 9 14 25 48 体系可能有害
Sample4 24 31 27 82 胚系、体系致病
Sample5 4 10 7 21 胚系意义不明
Sample6 33 32 27 92 体系有害

建库可选试剂


UDI接头试剂盒

杂交捕获可选试剂


TargetSeq One V2.0捕获试剂盒

通用封阻序列

捕获磁珠

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