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Y-STR基因测序

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Y-STR基因测序

艾吉泰康生物科技(北京)有限公司

 

  随着DNA 检测技术的不断发展,法医DNA 检测已成为现代司法鉴定中不可或缺的工具,与传统测序技术相比,下一代测序(Next Generation Sequencing,NGS)无论是测序原理、测序过程、适用范围还是测序结果都存在本质的不同,给生物学领域带来新的突破,对法医遗传学这一应用性学科也带来了冲击和挑战。

  iGeneTech®提供了基于二代测序(NGS)技术平台下在法医短串联重复(STR)分型中应用整体解决方案,在现有数据输出方式基础上,进一步关注STR的序列多态性,对公安部推荐的20个核心基因座进行精准识别鉴定。该解决方案基于iGeneTech®自主研发的MultipSeq®多重PCR扩增技术,获取法医相关的目标序列并进行上机测序。

 

产品信息

艾吉泰康生物科技(北京)有限公司

 

产品名称

基因座信息

AI-Y-STR-Multi

 DYS19、DYS385a/b、DYS389 I、DYS389 II、DYS390、DYS391、DYS392、DYS393、DYS437、DYS438、

 DYS439、DYS448、DYS456、DYS458、DYS635、H4、DYS481、DYS533、DYS576

 

 

产品优势

艾吉泰康生物科技(北京)有限公司

 

专属于中国人群的基因座。

包含了公安部要求的20个核心基因座并与现有数据库兼容,涵盖市面上大部分的Y-STR试剂盒基因座。

由长度多态水平提高到序列多态水平,对STR等位基因进行更为精细化的区分,对STR序列信息、SNV、InDel

   实现全解析度STR分型,显著提升法庭科学STR基因座的个体识别效力。

支持不同研究目的个性化定制服务,NGS高通量平行测序技术不再受荧光标记的种类限制,STR+More的检测策略

   实现了一次性检测更多遗传标记的种类和数量,能够大幅度提高检测效率。

 

 

技术路线

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技术参数

艾吉泰康生物科技(北京)有限公司

 

样本要求

唾液、口腔拭子、血卡等。gDNA1 ng,浓度>0.1 ng/ul

捕获平台

MultipSeq®

测序策略

Illumina PE250/300

服务周期

30个自然日

 

 

文献案例

艾吉泰康生物科技(北京)有限公司

 

案例一  大规模并行测序(MPS)对系统发育研究促进Y-STR变异的发现和分类

 

发表杂志:Forensic Sci Int Genet       IF:5.637            发表年份:2018

 

  Y染色体区域上男性特有的短串联重复序列(Y- STR)为单倍型,因此Y-STR序列多态性可以在单核苷酸多态性(SNPs)定义的单倍群系统发育的背景中。本文作者选择一组100个不同的样本,其中Y染色体上男性特有序列(MSY)通过重新测序先前定义了一个基于系统发育的高分辨率的SNP,并通过MPS对每个样本中的23个Y-STR进行测序,研究揭示了通过MPS在分析Y-STR上可提供额外更多的信息;同时也证明了MPS与CE数据的高度一致性(99.83%),促进了命名标准化,并且将Y-STR序列变异置于系统发育背景中。

 

艾吉泰康生物科技(北京)有限公司

图1 系统发育背景下检测到的SNP和InDel

参考文献

Huszar T I,Jobling M A , Wetton J.A phylogenetic framework facilitates Y-STR variant discovery and classification via massively parallel sequencing[J]. Forensic Science International: Genetics, 2018, 35:97-106.