En
新闻中心
NEWS
新闻中心
/
企业新闻
/
艾吉泰康携手拓普基因助力中国人群HRD研究

艾吉泰康携手拓普基因助力中国人群HRD研究

  • 分类:企业新闻
  • 作者:
  • 来源:
  • 发布时间:2020-09-09
  • 访问量:0

【概要描述】

艾吉泰康携手拓普基因助力中国人群HRD研究

【概要描述】

  • 分类:企业新闻
  • 作者:
  • 来源:
  • 发布时间:2020-09-09
  • 访问量:0
详情

近年来,PARP抑制剂药物在乳腺癌、卵巢癌、胰腺癌等研究中取得了令人瞩目的疗效,获益人群也从BRCA1/2基因变异患者扩展到HRD阳性人群。目前国内急需基于中国人群遗传背景的HRD检测产品。因此,艾吉泰康与拓普基因强强联合,携手开发适合中国人群的HRD检测产品。
▋▎什么是HRD?
HRR(homologous recombination repair, 同源重组修复)和PARP(poly(ADP-ribose)polymerase)是DNA损伤修复的两种重要机制,其中HRR参与DNA双链损伤修复,PARP负责DNA单链损伤修复,两种修复机制中的一种发生修复过程障碍时,另一种机制可以代偿修复。HRD(homologous recombination deficiency,同源重组修复缺陷)是描述HRR通路核心基因BRCA1/2变异或其他HRR基因变异、启动子甲基化、乃至一些不明机制导致的患者无法通过精确的同源重组通路来修复DNA双链断裂的状态。HRD阳性的肿瘤细胞对PARP抑制剂的治疗更敏感,这是由于DNA损伤修复机制HRR和PARP均被抑制,产生“合成致死”效应而杀死肿瘤细胞。
▋▎HRD检测助力PARP抑制剂精准治疗
PARP抑制剂是第一种成功利用“合成致死”概念获得批准在临床使用的抗癌靶向药物。2018年ESMO会议上震撼发布的SOLO1研究证明PARP抑制剂奥拉帕利安全性良好,用于携带BRCA基因变异的卵巢癌一线维持治疗可延长患者中位PFS长达3年。

图1:合成致死效应导致细胞凋亡
NOVA、ARIEL3等研究发现PARP抑制剂维持治疗最适用人群是BRCA基因变异患者,其次是HRD阳性患者。目前,国外经过临床验证且获FDA批准的HRD检测产品有两个:Myriad Genetics myChoice Test和FoundationOne CDx。Myriad myChoiceCDx(Myriad Genetics,Inc.)作为PRAP抑制剂药物的辅助诊断剂。该辅助诊断剂包含BRCA1/2基因编码区和54091个人群多态性位点,基于SNP(单核苷酸多态性)分型评估整个基因组层面的三种“基因组瘢痕”现象——杂合性缺失(LOH),端粒等位基因失衡(TAI),及大片段移位(LST)的总体情况,进行HRD Score评分。当患者BRCA基因变异阳性或HRD Score评分超过42分时,即判定为HRD阳性。FoundationOne CDx (F1CDx) 将HRD阳性定义为BRCA1/2基因变异或LOH评分高 (≥16%),但由于F1CDx仅评估了杂合性缺失这一种基因组瘢痕现象,可能会漏检一部分TAI和LST人群。

图2:基因组瘢痕
目前国内外已开发多个HRD评估方法,用不同的方法评估时结果差异往往较大。今年ASCO报道的一项研究(摘要号1586)揭示了Myriad Genetics myChoice Test与两种自建方法间检测结果的差异。如表1所示, Myriad Genetics myChoice Test判定的HRD阳性患者中,有19%-61%的患者会被两种自建方法(%LOH和11-gene panel)遗漏。由此可见在评估HRD时,选择经严格验证的方法至关重要。
表1 两种自建方法(%LOH和11-gene panel)与myChoice HRD方法之间的阳性符合率(PPA)和相关性

▋▎艾吉泰康携手拓普基因助力中国人群HRD状态分层
SNP位点分布在不同人群中差异很大。只有经过中国人群样本测试和验证的HRD模型才能更加精准的反映中国人群的HRD状态。因此,艾吉泰康携手拓普基因基于中国人群遗传背景以及疗效数据开发适合中国人群的HRD检测产品。该HRD检测产品纳入39个HRR通路核心基因与中国人群一致且能有效覆盖整个基因组的数万个SNP位点。经过精心设计和多次调整,确保产品的区域覆盖度、捕获效率和均一性。该产品既可以单独使用,又可以与已有panel(全外显子、泛癌种panel和单一癌种panel)联合使用以检测HRR通路基因变异和基因组不稳定性指标(LOH、TAI和LST),判断患者HRD状态,从而全面筛选铂类/PRAP抑制剂药物获益人群。

此外,拓普基因为了造福中国女性肿瘤群体,已开发出符合中国人群遗传特征的遗传性肿瘤筛查产品:普媚妍®(乳腺癌/卵巢癌等遗传易感基因BRCA1/2)和普姿妍®-同源重组缺陷(HRD)69基因检测。产品的详细介绍可参考推文:

1.拓普基因BRCA荣耀之路:https://mp.weixin.qq.com/s/zTzjgVXoPv20rNSkLjktKg

2. 大有所为!ASCO 2020关于同源重组缺陷(HRD)的研究:https://mp.weixin.qq.com/s/YHwfCnvtJTHPDgjun6iyFA

 

参考文献:


[1]Norderomeer, S.M.; van Attikum, H. PARP Inhibitor Resistance: A Tug-of-War in BRCA-Mutated Cells. Trends Cell. Biol. 2019, 29, 820–834, doi:10.1016/j.tcb.2019.07.008.
[2]PARP inhibitors:Synthetic lethality in the clinic.Science.2017 Mar17;355(6330):1152-1158.

[3]Telli, M. L. et al. Homologous Recombination Deficiency (HRD) Score Predicts Response to Platinum-Containing Neoadjuvant Chemotherapy in Patients with Triple-Negative Breast Cancer. Clin. Cancer Res.22, 3764–3773 (2016).

扫二维码用手机看

推荐新闻

版权所有: 艾吉泰康生物科技(北京)有限公司
SEO 网站建设: 中企动力 北京