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HLA基因分型测序

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HLA基因分型测序

 

  人类白细胞抗原(Human Leukocyte Antigen,HLA),又被称为人类的MHC(Major Histocompatibility Complex),是控制细胞间相互识别、调节免疫应答的一组紧密连锁基因群。HLA位于人类6号染色体短臂6p21.3上长度约4.0 Mb的区域内,具有高度的遗传多态性。由于HLA部分基因编码细胞表面抗原受体,成为每个人的细胞不可混淆的“特征”,是免疫系统区分自身和异体物质的基础,而广泛应用于免疫相关疾病的研究、器官和骨髓移植、疫苗和药物靶向人群筛选、肿瘤免疫研究等。艾吉泰康基于自主研发液相探针杂交捕获技术平台,提供了HLA分型的整体解决方案,全面检测HLA-A、B、C、DRB1、DQB1、DPB1 6个基因,提供更全面更有针对性的精准分型分析结果,助力科学研究。

 

 

 

产品信息

 

产品名称

HLA分型检测

目标区域大小

15.65 kb

检测范围

HLA-ABCDRB1DQB1DPB1

技术平台

TargetSeq®

 

 

产品优势

 

灵敏度高:采用特异性强的检测方法,灵敏度高,所需样本量少

分辨率高:实现6位的高精度分型

检测全面:全面覆盖HLA Ⅰ类分子(A,B,C)的全长序列和Ⅱ类分子(DRB1,DQB1,DPB1)的全外显子序列,

                   检测范围更全面

准确度高:基于NGS高通量测序,避免模棱两可结果,检测结果更准确

选择灵活:灵活定制HLA多位点基因检测Panel

 

 

 

技术路线

艾吉泰康生物科技(北京)有限公司
 

技术参数

 

样本要求

DNA≥500 ng(浓度≥5 ng/μL),新鲜组织≥20 mg,全血(提取基因组DNA)≥1 mL,干血片≥3片(1 cm2面积),唾液≥1 mL,口腔拭子≥1根,新鲜培养细胞≥5×106个,FFPE(石蜡切片)≥10片(1 cm2面积,5-10 μm)

捕获平台

AI-HLA-Cap

测序策略

Illumina PE150

服务周期

15个自然日

 

 
 

文献案例

 

案例一 肺癌进化过程中HLA等位基因的杂合性缺失和免疫逃逸现象

 

发表杂志:Cell            IF:31.398            发表年份:2017

 

  肿瘤新抗原的识别是产生免疫应答的关键,而HLA的表达及结构的完整性是新抗原递呈的基础。本文作者开发了一种研究HLA LOH(loss of heterozygosity in human leukocyte antigen,HLA杂合性缺失)的分析方法,从肺癌进化角度研究了HLA拷贝杂合缺失对免疫逃逸的影响。利用该方法在肺癌研究中发现,40%的NSCLCs样品中存在HLA LOH现象,并且与高的亚克隆新抗原负荷、APOBEC介导的突变、细胞溶解活性的上调和PD-L1阳性相关。结果进一步证实,HLA LOH是导致肿瘤免疫逃逸的主因之一。

 

 

艾吉泰康生物科技(北京)有限公司

 

图1 非小细胞肺癌(NSCLC)中HLA LOH的表现

 

 

参考文献

Mcgranahan N, Rosenthal R, Hiley C T, et al. Allele-Specific HLA Loss and Immune Escape in Lung Cancer Evolution[J]. Cell, 2017, 171(6):1259-1271.e11.