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喜讯!艾吉泰康参与编写的HRD临床检测与应用专家共识重磅发布!

喜讯!艾吉泰康参与编写的HRD临床检测与应用专家共识重磅发布!

  • 分类:企业新闻
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  • 来源:
  • 发布时间:2022-05-09
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喜讯!艾吉泰康参与编写的HRD临床检测与应用专家共识重磅发布!

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重磅新闻

近日,同源重组修复缺陷临床检测与应用专家共识(2021版)正式发表于《中国癌症防治杂志》,艾吉泰康联合创始人屈武斌老师参与编写。2020年,艾吉泰康正式发布首款HRD检测试剂盒,并基于自身技术优势推出包括SNP位点选择、Panel合成以及HRD分值计算的整体解决方案,全面助力中国HRD检测标准化与规范化进程。


随着PARP抑制剂的问世及临床研究的不断深入,同源重组修复缺陷(homologous recombination deficiency,HRD)临床检测规范化和标准化需求日益迫切。为了提高临床医师及检测等相关人员对HRD临床意义及检测规范的认识,更加准确合理地开展HRD检测及结果解读,为患者提供更优质的临床服务,中国抗癌协会肿瘤标志专业委员会遗传性肿瘤标志物协作组联合中华医学会病理学分会分子病理学组组织编写了《同源重组修复缺陷临床检测与应用专家共识》(下称《共识》),并于9月10日在《中国癌症防治杂志》重磅发布。

《共识》围绕HRD定义描述、HRD肿瘤临床病理与分子特征、HRD检测的临床应用价值、HRD检测样本选择、HRD检测技术选择与确认、HRD算法标准化及HRD临床检测和应用的问题等关键点,结合国内外应用现状,为临床提供7条HRD临床检测与应用专家共识。艾吉泰康联合创始人屈武斌老师参与HRD检测技术选择与确认部分的编写。

【专家共识一】HRD定义描述


HRD通常指细胞水平的同源重组修复(homologous recombination repair,HRR)障碍状态,HRD会产生可量化的、稳定的基因组改变,目前主要通过LOH、TAI和LST 3个指标的综合检测得出基因组不稳定评分(genomic instability score,GIS),临床实践中以BRCA1/2 基因致病性突变与GIS评估肿瘤HRD状态。鉴于HRR通路以及细胞信号通路的复杂性,通过临床检测方法实现肿瘤细胞HRD全面而准确的评估仍具挑战。

图1. 以基因组不稳定指标评估HRD状态
【专家共识二】HRD的临床应用

HRD是恶性肿瘤较为常见的分子标记,卵巢癌、乳腺癌、前列腺癌、胰腺癌发生率较高;HRD阳性卵巢癌、乳腺癌表现出一定的临床病理学特征,BRCA相关的遗传性乳腺癌和卵巢癌表现更显著。HRD是较稳定的恶性肿瘤分子标记,其评估通常不受肿瘤取材部位(同一部位不同病灶或原发和转移病灶)影响。

HRD临床检测在PARP抑制剂治疗晚期卵巢癌疗效预测中具有重要的应用价值,可对卵巢癌患者进行分层,优化相应治疗决策,最大限度扩大PARP抑制剂临床获益人群;在乳腺癌、胰腺癌、前列腺癌中,其对PARP抑制剂或含铂类药物的临床应用可能也具有潜在的指导价值,相关研究尚在探索中。另外,我国尚无获批的HRD检测试剂,临床实施检测时应依据患者肿瘤类型、分期与诊疗史,并在患者充分知情同意前提下,选择与适应证和(或)拟应用的PARP抑制剂种类最匹配且经严格性能验证的商业试剂盒。

图2. HRD检测可使PARP抑制剂获益人群最大化
【专家共识三】HRD临床检测规范化


HRD检测优先选择3年以内的石蜡包埋肿瘤组织,并观察肿瘤细胞的含量和数量,以保证有足够的肿瘤细胞用于检测;若含量不足,应进行富集,尽可能避免出血和坏死区域。新鲜组织不推荐作为常规检测样本类型,若使用需先评估其肿瘤细胞含量。建议提供患者配对外周血作为非肿瘤对照样本,这有助于了解胚系BRCA1/2以及其他HRR相关基因突变情况。
基于SNPs的“基因组瘢痕”分析是当前最具应用前景的HRD临床检测方法,能从BRCA野生型肿瘤患者中有效筛选出PARP抑制剂治疗的潜在获益人群。当前亟待推进我国相应合规试剂盒的开发与验证工作,其SNPs位点选择与Panel设计应着重把握我国人群的分子遗传学特征,并积极倡导联合开展PARP抑制剂前瞻性多中心临床研究验证。

图3. 基因组瘢痕现象示意图
在HRD临床检测中,基于SNPs位点信息进行HRD评分计算的准确度主要依赖于对SCNV的准确分析;同时,通过WGS、WES等检测技术获取更多的基因组信息,有助于进一步提升HRD评分计算的准确度;应用人工智能技术辅助分析HRD的多维度特征,已展示出高效识别HRD阳性人群的潜在优势。必须强调的是,任何一种检测方法、评分计算方法和判断标准在临床正式应用前,都需要经过严格的性能分析与临床效能验证。
HRD临床检测报告内容除重点描述BRCA1/2 等HRR相关基因变异情况以及GIS计算数值外,还应针对相应癌种的PARP抑制剂疗效预测价值进行解读;HRD评分阈值判定与不同癌种、不同PARP抑制剂及其相应适应证有关。同时,目前尚缺乏HRD评分应用于中国人群PARP抑制剂疗效预测的大样本临床研究数据,报告应着重阐述其检测的局限性。
《共识》中明确指出,HRD检测Panel设计时应符合我国人群的分子遗传学特征,SNPs位点的选择应注意把握2个要点:一是位点的分布需相对均匀,以避免某些区域出现未覆盖的情况;二是需要尽可能地覆盖更多的杂合位点。要确保实现上述2个目标,HRD Panel设计上应优先选择中国健康人群频率在0.4~0.6之间的SNPs位点;同时需避免覆盖严重偏离哈迪-温伯格平衡以及探针无法稳定覆盖的位点。
艾吉泰康HRD产品助力中国人群HRD状态分层


十年磨一剑,艾吉泰康屈武斌老师长期致力于寡核苷酸分子杂交特性的理论建模、PCR 引物及探针特异性与敏感性的分析与预测,为HRD检测位点选择及探针设计奠定了坚实的理论与实践基础。为助力国内HRD临床研究,加速HRD检测标准化进程,艾吉泰康基于多年数据积累及产品设计经验,于2020年推出基于中国人群遗传背景以及疗效数据开发的HRD检测试剂盒。该产品包含HRR通路中39个核心基因以及与中国人群频率一致且能有效覆盖整个基因组的约3.7万个SNP位点,可有效评估基因组不稳定性指标(LOH、TAI和LST),判断患者HRD状态,进而筛选铂类/PRAP抑制剂药物获益人群,为卵巢癌、乳腺癌、前列腺癌等多种实体瘤患者提供用药指导。

图4. iGeneTech HRD评分试剂盒SNP位点分布情况
现在,艾吉泰康秉承初心,在HRD检测规范化和标准化进程中不断深入探索。为了更好的服务于临床研究,艾吉泰康研发团队可针对不同方向提供HRD位点选择、Panel合成以及HRD分值计算的专业指导,开放合作、精益求精。通过越来越多的临床医师、病理医师、分子检测人员、临床药师和肿瘤生物学专家更深入和广泛地参与研究,我们相信HRD精准评估和应用前景值得期待,更多的肿瘤患者可以从中获益。
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